Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gna11P21278 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gna11P21278 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gna11P21278 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms