Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NefhP19246 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NefhP19246 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms