Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18528 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18528 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18528 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18528 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms