Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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