Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms