Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax1P09084 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax1P09084 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms