Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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