Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CrxO54751 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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