Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited2O35740 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms