Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms