Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms