Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snap23O09044 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms