Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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