Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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