Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm20795J3QP49 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20795J3QP49 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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