Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm19965J3QNY8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm19965J3QNY8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm19965J3QNY8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm19965J3QNY8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm19965J3QNY8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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