Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam240aJ3QNP9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms