Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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