Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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