Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms