Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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H2-M5A7VMS3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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H2-M5A7VMS3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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H2-M5A7VMS3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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