Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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