Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms