Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RfxankQ9Z205 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms