Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ramp1Q9WTJ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ramp1Q9WTJ5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms