Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms