Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Six6Q9QZ28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Six6Q9QZ28 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Six6Q9QZ28 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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