Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrfQ9JM73 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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