Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclk1Q9JLM8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclk1Q9JLM8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms