Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod4Q9JLH8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tmod4Q9JLH8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tmod4Q9JLH8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tmod4Q9JLH8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod4Q9JLH8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms