Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tgm1Q9JLF6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tgm1Q9JLF6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tgm1Q9JLF6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tgm1Q9JLF6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms