Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Msrb1Q9JLC3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms