Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trem1Q9JKE2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms