Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms