Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup50Q9JIH2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup50Q9JIH2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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