Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms