Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms