Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms