Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hmg20aQ9DC33 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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