Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms