Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms