Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms