Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cfap53Q9D439 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cfap53Q9D439 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cfap53Q9D439 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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