Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf128Q9D304 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms