Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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