Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pin4Q9CWW6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pin4Q9CWW6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pin4Q9CWW6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pin4Q9CWW6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pin4Q9CWW6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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