Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9CWU4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms