Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms