Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tm4sf20Q9CQY8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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