Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms